제품 특장점
Targeted Locus Amplification (TLA) Technology
Target 및 whole genome sequencing의 발전에도 불구하고, 구조 변형을 포함한 모든 유전적 변이, 관심 유전자, 대립 유전자의 특이적 검출을 위한 방법은 여전히 도전 과제로 남아 있습니다. Targeted locus amplification (TLA) 기술은 짧은 locus-specific 서열에 상보적인 한 쌍의 프라이머를 사용하여 표적 영역을 둘러싸고 있는 100 kb 이상의 연속 서열을 포괄하는 DNA 라이브러리를 생성하는 기술입니다. 차세대 시퀀싱과 함께 TLA를 사용하면 관심있는 대상 영역의 시퀀싱과 haplotyping을 완벽하게 수행할 수 있습니다.
Genomic DNA의 crosslinking을 진행하며, 이는 물리적으로 매우 근접한 DNA 사이에서 우선적으로 일어납니다.
동일한 유전자좌로부터 시퀀스를 연결 (빨간색으로 표시)
가교된 DNA는 단편화되고, Ligase에 의해 다시 연결시켰다가 crosslinking을 풀어줍니다.
동일한 유전자좌에서 유래한 DNA 단편으로 구성된 긴 scratch들이 TLA template가 됩니다.
이 template은 단편화 되고 원형화 됩니다.
개별 locus 내의 DNA 조각들이 crosslinking, 재결합을 일으키는 통계적 차이는 해당 locus에서 유래한 DNA 조각
들의 고유한 조합으로 구성된 원형 DNA를 모두 확인할 수 있게 합니다.
원형 DNA 단편 내 관심 유전자 정보는 유전자좌 특이적 서열에 상보적인 inverse primer에 의해 증폭됩니다.
결과적으로 완전한 유전자좌가 증폭되고 차세대 sequencing 기술로 염기서열을 분석할 수 있습니다.
이러한 방식으로 TLA 기술은 targeted hypothesis-neutral sequencing을 가능하게 합니다. 또한 종양과 같은 다양
한 변이가 섞여 있는 시료에서 관심있는 유전자좌의 모든 서열 및 구조적 변이체를 검출 할 수 있습니다.
TLA 기술은 multiplexing을 허용합니다. 다중 유전자좌에서 multiplex로 또는 다수의 개별위치에서 각각 증폭될 수 있습니다.
