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단일세포 유전체 연구에서 시퀀싱 데이터의 품질은 중요한 요소 중 하나입니다. 세포나 조직 등의 샘플 상태가 좋지 못할 경우, 전체 유전자 발현 프로파일 분석에 부정확한 결과를 초래합니다. NanoCellect의 WOLF Cell Sorter를 사용하여 단일세포 시퀀싱 전에 유효한 세포 샘플을 쉽게 분리해 낼 수 있습니다. 죽은 세포나 debris를 제거해 줌으로써 시간과 비용을 절약할 수 있습니다. 온화한 세포 분리 기술을 사용하여 샘플 품질을 높임으로써, 유전체 시퀀싱 분석을 성공적으로 수행할 수 있습니다. 특히, 이번 웨비나에서는 다음과 같은 내용을 다룰 예정입니다.  The crucial role of cell viability for sequencing data readout WOLF Cell Sorter capabilities for targeted isolation of viable cellsReal-world applications in genomics workflows  Speaker    Micayla GeorgeLab Research Associate at NanoCellect Micayla earned her Bachelor’s degree in Molecular Biology from Pomona College in California. She previously worked as a research assistant at the Ragon Institute of Mass General, MIT, and Harvard on projects in the single cell genomics and immunology spaces. As a lab research associate at NanoCellect, she works as a part of the Applications Team on the continued development of gentle cell sorting technologies.

AEpiA Epigenetics Seminar Australian Epigenetics Alliance Group에서 주관하는 웨비나를 소개합니다. AEpiA 후성유전체 세미나는 후성유전체에 관한 최신 연구 내용을 소개하고 토론하는 자리이며, 3D 게놈 구조 분석 솔루션을 취급하는 Cantata Bio에서 후원하고 있습니다. 이번 웨비나에서는 구조적 변이가 염색질 구조에 어떻게 영향을 미치고 질병에 어떤 영향을 끼치는지에 대해 소개해 드릴 예정입니다. 관심 있으신 분들의 참여바랍니다. Speaker     Dr Kennerson is a Professor of Neurogenetics/Neurosciences with the ANZAC Research Institute, Sydney Local Health District (SLHD) and the School of Medical Sciences, University of Sydney, Australia. She heads the Translational Gene Discovery and Functional Genomics Inherited Peripheral Neuropathies Program at the ANZAC Research Institute. Her team has discovered several neuropathy genes and is doing pioneering research to investigate the role of structural variation and its role in new disease mechanisms for hereditary neuropathies. Her research program includes functional studies for recent gene (ATP7A and PDK3) and SV mutation (CMTX3 and DHMN1) discoveries using induced pluripotent stem cell derived motor neurons and animal models (C. elegans). Marina is a board member of the Charcot-Marie-Tooth and Related Neuropathies Consortium (CMTR), Chair of the Asian Oceanic Inherited Neuropathy Consortium (AOINC) serves on the Scientific Advisory Board of the CMT Research Foundation, USA and is Deputy Director (Research) of the SLHD Institute of Precision Medicine and Bioinformatics.   AEpiA는 호주, 뉴질랜드 및 기타 11개국의 연구자들로 구성된 커뮤니티이며, 600여명이 속해 있습니다. 이 단체 회원들은 DNA 메틸화, 히스톤 변형, miRNA, 염색질 확인, 발달 생물학, 노화, 진화, 농업 과학 및 의학 연구를 포함하여 후성유전학적 조절 및 생물학의 다양한 연구에 관심을 갖고 있습니다. AEpiA는 매달 온라인으로 세미나를 개최하여, 후생유전학 연구 분야의 국제 리더와 호주 과학자들이 참여하고 있습니다. 

단일세포 분석은 복잡한 조직 유형, 희귀세포군, 유전자 간의 조절 관계를 규명할 수 있는 강력한 기술입니다.​이번 웨비나는 10x Genomics에서 지난 8월 10일과 11일 양일간 개최한 "Single Cell for Beginners" 웨비나 내용을 기반하여, 단일세포 분석 연구를 시작하는 분들께 실험 전반에 관해 소개해 드리기 위해 기획된 행사입니다. 단일 세포 분석을 위한 실험 설계의 핵심 고려 사항부터 시작하여, 성공적인 단일세포 유전자 발현 분석 위한 샘플 준비 과정 및 단일세포 분석 방법, 데이터 분석 파이프라인 등을 소개해 드릴 예정입니다. ​단일세포 시퀀싱(Single cell RNAseq)은 기존의 bulk 유전자 발현 분석 방식을 넘어서, 개별 세포의 유전자 발현을 상세히 분석하여 세포의 다양성과 유전자들의 복잡한 조절 관계를 밝혀낼 수 있습니다. 단일세포 분석에 관하여 관심 있으신 분들의 많은 참여 바랍니다.세션1: What is single cell - assay, experimental design, best practice세션2: Single cell data analysis workflow from QC to visualization연자 소개    유지숙(주)다온비에스 / Field Application Specialist    손승한(주)다온비에스 / Field Application Specialist

공간 전사체학은 조직의 형태학적 맥락을 유지하면서 조직 섹션에 대한 전체 전사체 정보를 매핑할 수 있는 획기적인 분자 프로파일링 기술입니다. 10x Genomics의 Visium CytAssist 장비를 통해 구현되는 Visium Spatial 분석기법은 FFPE, fixed, fresh frozen tissue 등에 적용될 수 있습니다.Visium CytAssist 장비는 표준 유리 슬라이드에서 Visium 슬라이드로 전사체 probe를 자동 이동시켜 줌으로써 공간 전사체 분석을 위한 시료 준비를 간소화 시켜 줍니다.이번 웨비나에서는 아래와 같은 내용들을 다룰 예정입니다.The importance of spatial gene expression analysis and applicationsThe ultimate flexibility researchers now have to access their samples of interest with Visium CytAssist–enabled workflows10x Genomics spatial product development on the Visium CytAssist instrumentSpeaker    Lauren GutgesellMolecular Biology Scientist10x Genomics

유전체학의 발전으로 유전자 조절에 대한 이해가 혁신적으로 변화했고, 발단 생물학부터 질병 연구에 이르기까지 다양한 분야에서 중요한 발견이 이루어졌습니다. 이러한 혁신을 이끌어 내는 도구 중 하나가 Dovetail Pan Promoter Panel이며, 이것은 유전자 조절의 복잡성을 쉽게 해독하기 위해 고안된 솔루션입니다.  이번 세미나에서는 학계 전문가를 초청하여 조절 유전체학의 연구사례를 살펴보고, Dovetail Pan Promoter Panel를 이용하여 유전자 발현의 숨겨진 비밀을 어떻게 풀어내는지에 대해 소개해 드릴 예정입니다. 연자 소개     Professor Yasuhiro MurakawaKyoto University Institute for Advanced Study (KUIAS)Dissecting human disease pathways using high-resolution chromatin contact mapsLarge-scale genome-wide association studies (GWAS) have yielded an increasing number of disease-associated genomic loci. However, the functional interpretation still largely remains unclear. Recently, it has become apparent that disease-associated genetic variants are often found within enhancers. Enhances act to strongly enhance the expression of their target genes in a cell-type specific fashion, by physically associating with their promoters. We have developed a 5’-end single-cell RNA sequencing approach to comprehensively map active enhancers from heterogeneous helper T cells. By integrating with GWAS datasets, we identified hundreds of human enhancers associated with autoimmune diseases. To gain important clues to human disease pathways, here we used Micro-C as well as promoter-capture Micro-C, methods that can analyze chromatin interactions with super-high resolution. We systematically identified target genes of these enhancers, revealing novel human disease molecular mechanisms. In sum, we provide a general framework to investigate molecular mechanisms underlying human diseases.    Myriam ElkhawandCustomer Success Manager, Dovetail Genomics Setting up the Dovetail® Pan Promoter Assay in the lab In this second talk, Myriam will delve into the details of Dovetail Pan Promoter protocol and library quality control measures that play a pivotal role in assessing the success of the assay. She will discuss best practices in carry out the assay, library QC, emphasizing the importance of stringent quality standards for reliable data analysis. She will also share the analysis pipeline for Dovetail Pan Promoter panels.