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식물은 우리의 건강과 영양에 기본적이며, 아직 발견되지 않은 많은 중요한 천연 약물을 제공합니다. 식물 생물학에서 중요한 과제 중 하나는 식물이 다세포 생물체이지만 발견해야 할 많은 점들은 식물의 단일 세포의 분리 및/또는 농축을 필요로 합니다. 부드러운 세포 분류는 유전자 특성 및 기능, 단백질체학 및 전사체학, 단일 세포 유전체학, 유전자 편집 또는 유전자 공학을 통한 개량된 세포주 개발, 우수한 품종을 생산하기 위한 식물 생물학 워크플로우의 효율성을 높이는 유용한 도구입니다.전통적인 cell sorter에서는 식물 protoplast 및 엽록체와 핵과 같은 소립자들을 분리하는 것이 높은 시료 압력, shear stress 및 삼투압 등의 변화로 인해 후속 응용에 사용할 수 없게 됩니다. Microfluidic 기술을 활용한 WOLF G2® 세포 분류기는 낮은 시료 압력과 customizable sheath fluid를 사용하여 세포의 생명력과 세포막 무결성을 지원합니다.이번 웨비나에서는 특히 아래와 같은 내용을 다룰 예정입니다.FACS 장비를 이용한 식물 세포를 분류시 한계식물 세포 생명력을 보존하기 위한 맞춤형 시액 유체와 낮은 시료 압력의 중요성WOLF G2를 이용한 protoplast, 핵 및 배아형성 미세포를 농축 및 분류하여 단배체 식물로 재생하는 능력 소개Speaker    Dorinda MoelleringSenior Scientist at NanoCellect  Dorinda Moellering is a Senior Scientist at NanoCellect Biomedical and a member of the applications development team.  She develops applications for cell sorting in plant/agriculture, marine biology, and mammalian research spaces.  She has over 15 years of biotech industry experience – five years working on algal biofuels, and a decade in plant cell biology and flow cytometry.  Her undergraduate and graduate research studies focused on understanding biological processes and roles of numerous phytoplankton species which are key to carbon fixation in the world's oceans.  Dorinda has a Master of Science degree in Molecular and Cellular Biology from California State University San Marcos and a Bachelor of Science degree in Marine Biology from the California Polytechnic State University San Luis Obispo.  

다온비에스는 2023년 11월 13일~15일, 여수 소노캄에서 개최하는 "BIOINFO 2023 정기학술대회"에 전시와 런천세미나로 참여합니다.  BIOINFO 2023 정기학술대회, 런천세미나에서 10x Genomics의 Spatial Solutions에 대한 overview와 다양한 연구에 활용된 사례를 소개해 드릴 예정입니다. 10x Genomics는 단일 세포 수준에서 유전체 발현 정보를 분석할 수 있는 솔루션 뿐만 아니라, 조직의 해리없이 온전한 조직의 전사체 정보와 위치 정보를 함께 관찰할 수 있는 Spatial Solutions을 제공하고 있습니다.  이번 런천세미나에서 특히 sub-cellular resolutions으로 전사체 및 단백질체의 발현 및 위치 정보를 분석할 수 있는 Xenium In Situ에 대한 소개도 해 드릴 예정입니다. 관심 있으신 분들의 많은 참여 바랍니다. 런천세미나 이외에 전시 부스를 운영합니다. 다온비에스 부스에 오시면 유전체 발현 정보를 성공적으로 분석하기 위한 sample prep 솔루션에서 NGS에 이르기까지 다양한 제품을 만나실 수 있습니다. 런천세미나 일정일시: 2023년 11월 14일 (화) 12:15 - 15:45장소: 전남 여수 소노캄, 그랜드볼룸 I런천세미나 연자     Biology at true resolution: Resolve biological complexities with spatial solutions 정은실 부장 10x Genomics, Field Application Scientist  ※ 자세한 제품 상담을 원하시면, 다온비에스 부스 (위치: #5, 그랜드볼룸 1층)를 방문해 주세요!

조직을 손상시키지 않고 조직 내에서 유전자 발현을 정량화하고 위치를 파악함으로써 세포 유형, 세포간 상호작용 및 세포 상태의 공간 구조를 탐색할 수 있는 강력한 도구로 떠오르고 있는 공간적 분해능을 갖춘 단일 세포 분석은 중요한 역할을 하고 있습니다.Xenium Analyzer는 조직 내 RNA의 매우 민감하고 특이적인 검출을 통해 In Situ 분석을 수행할 수 있는 토탈 솔루션을 제공하며, 샘플을 기기에 장착한 후 일련의 decoding 및 분석 과정이 완전 자동으로 실행됩니다. Xenium은 fresh frozen 및 FFPE 샘플을 지원하며, Xenium In Situ 워크플로우를 사용하여 처리된 조직 절편은 실행 후에도 대부분 그대로 유지되어, 면역형광 염색, H&E 염색 및 Visium CytAssist 기기를 사용한 전체 전사체 프로파일링과 같은 추가 어플리케이션에 사용할 수 있습니다.이번 웨비나에서는 Xenium을 이용한 공간적 단일 세포 생물학의 여러 예시를 보실 수 있으며, 또한, RNA 프로파일링 및 세포 유형 분류, isoform 검출, 리간드 신호 및 세포 유형 차별화 등을 어떻게 규명해 내는지 확인할 수 있습니다. Speaker     Byron Hartman PhD Staff Product Manager, Xenium Assays 10x Genomics

유전자 발현 정보를 형태학적 맥락과 함께 평가하는 것은 생물학과 질병의 진행을 이해하는데 중요합니다. 복잡하고 이질적인 조직을 high-throughput 방식으로 분석하는 것은 어려운 과제였으며, 특히 유전자 발현에 대한 사전 생성된 가정 없이 이를 수행하는 것은 더욱 어려웠습니다.10x Genomics에서 양일간 진행하는 Spatial Webinar Series에서는 Visium Spatial 제품을 사용하여 H&E 또는 면역 형광 염색된 fresh frozen 또는 FFPE 조직 절편의 전사체를 분석하는 방법을 소개해 드릴 예정입니다. 또한 공간 분석 방법, 샘플 처리 방법, 데이터 분석 워크플로우에 대한 정보를 얻을 수 있습니다.●   11월 1일: 공간 분석 - 실험 설계, 분석 및 모범 사례●   11월 2일: 공간 데이터 분석 - QC에서 시각화까지의 워크플로우Speakers    Ivonne Petermann, PhDSenior Science and Technology Advisor, ANZ10x Genomics    Quy Xiao Xuan Lin, PhDSenior Scientist, Applied Bioinformatics10x Genomics

"대장암 TME에 대한 혁신적인 연구 사례 발표” 대장암(CRC)은 전 세계에서 세 번째로 발병률이 높은 암 종류로, 그에 대한 연구의 중요성은 더욱 커지고 있습니다. 종양 미세환경(TME) 내에서 암 세포와 그 이웃 세포들 간의 복잡한 상호 작용은 질병 진행과 예후에 큰 영향을 미칩니다. 이번 한국유전체학회 런천세미나에서 다온비에스(10x Genomics 한국대리점)는 Genome Institute of Singapore에 계신 Li Bo 박사를 초청하여 새로운 기법으로 대장암의 TME를 분석한 연구 결과를 소개해 드릴 예정입니다. 일찍이 Li Bo 박사 연구팀은 CRC TME를 이해하기 위해 단일세포 RNA 시퀀싱과 공간 오믹스 기술을 결합하는 등 다각적인 접근 방식을 채택했습니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱을 사용하여 CRC TME에 존재하는 모든 주요 세포 유형을 포괄적으로 특성화하고 획득한 지식을 활용하여 이러한 관심 있는 세포 유형의 공간적 위치와 종양 구조 내에서의 상호 작용을 조사하기 위해 10x Xenium In Situ Analyzer를 사용했습니다.  이번 런천 세미나를 통해 CRC 종양 생물학에 대한 이해와 CRC에 대한 새로운 표적 치료 개발에 통찰력을 얻으시는 기회가 되시기 바랍니다. 관심 있으신 분들의 많은 참여 바랍니다. Speaker   Li Bo, PhD. Senior Research FellowLaboratory of Systems Biology & Data Analytics, Genome institute of Singapore Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer in the world. Within the tumor microenvironment (TME), cancer cells are surrounded by diverse cell types including cancer-associated fibroblasts (CAFs) and immune cells. These neighboring cells can have a profound effect on prognosis and disease progression by providing local signals that impact tumor growth and metastasis. Prior work in the lab has identified via single cell RNA sequencing novel subtypes of cancer epithelial cells and enrichment of specific CAFs within the CRC TME. However, the locations and signaling interactions of these cells within the tumors remain poorly understood due to the loss of spatial information. In this study, we adopt a multi-facet approach to try to understand the CRC TME by utilizing a combination of single cell RNA sequencing and spatial omics technology. We first comprehensively characterized all the major cell types present in the CRC TME using single cell RNA sequencing, and with the knowledge gained, we set out to investigate the spatial localization of these cell types of interests and their interactions within the tumor architecture using the 10x Xenium Analyzer.  From the pilot xenium dataset we have generated so far, we were able to recapture most if not all of the major cell types from single cell RNA sequencing, Importantly, we identified subtypes of cancer epithelial cells that occupy unique spatial niches within and across tumor crypts. We also observed an enrichment of CAFs and immune cell populations at the tumor invasive margin. Further study of these cancer epithelial, CAF and immune subtypes and their spatial interactions may reveal new insights into CRC tumor biology and assist in the development of targeted therapies for CRC.