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뇌 조직과 종양 생검 등 매우 이질적인 샘플의 단일 세포 분석을 통해 얻은 세포 데이터는 유용한 생물학적 통찰력을 제공합니다. Chromium Single Cell Gene Expression Flex와 같은 혁신적인 기술은 fresh, frozen 그리고 fixed sample, 심지어 FFPE 샘플에 대해 높은 민감도와 유연한 워크플로우를 제공하여 발견 가능성을 넓힙니다. 그러나 이러한 발전된 단일 세포 전사체 분석 기술을 사용하려면 그 기능에 상응하는 소프트웨어 도구가 필요합니다. 이번 웨비나에서는 이미 검증된 Loupe Browser의 새로운 기능을 소개합니다. Loupe 7.0에 대한 기능과 Flex tutorial dataset를 활용한 안내를 통해 아래 내용들을 배울 수 있습니다.Seamlessly move between Loupe 7.0 and community-developed tools written in R using our new .cloupe conversion package, LoupeRPerform multi-sample comparisons between two experimental conditions using a pseudo-bulk approachReveal cell types present across lung cancer disease states and gene expression changes before and after therapeutic treatments연자Loupe & LoupeR: new ways to analyze data & collaborate    Emily GranthamScientist, Applied Bioinformatics

유전자 발현 정보를 형태학적 맥락과 함께 평가하는 것은 생물학과 질병의 진행을 이해하는데 중요합니다. 복잡하고 이질적인 조직을 high-throughput 방식으로 분석하는 것은 어려운 과제였으며, 특히 유전자 발현에 대한 사전 생성된 가정 없이 이를 수행하는 것은 더욱 어려웠습니다.​다온비에스에서 진행하는 이번 웨비나에서는 Visium Spatial 제품을 사용하여 H&E 또는 면역 형광 염색된 fresh frozen 또는 FFPE 조직 절편의 전사체를 분석하는 방법을 소개해 드릴 예정입니다. 또한 공간 분석 방법, 샘플 처리 방법, 데이터 분석 워크플로우에 대한 정보를 얻을 수 있습니다.세션1: 공간 분석 - 실험 설계, 분석 및 모범 사례세션2: 공간 데이터 분석 - QC에서 시각화까지의 워크플로우연자 소개    유지숙(주)다온비에스 / Field Application Specialist    손승한(주)다온비에스 / Field Application Specialist

식물은 우리의 건강과 영양에 기본적이며, 아직 발견되지 않은 많은 중요한 천연 약물을 제공합니다. 식물 생물학에서 중요한 과제 중 하나는 식물이 다세포 생물체이지만 발견해야 할 많은 점들은 식물의 단일 세포의 분리 및/또는 농축을 필요로 합니다. 부드러운 세포 분류는 유전자 특성 및 기능, 단백질체학 및 전사체학, 단일 세포 유전체학, 유전자 편집 또는 유전자 공학을 통한 개량된 세포주 개발, 우수한 품종을 생산하기 위한 식물 생물학 워크플로우의 효율성을 높이는 유용한 도구입니다.전통적인 cell sorter에서는 식물 protoplast 및 엽록체와 핵과 같은 소립자들을 분리하는 것이 높은 시료 압력, shear stress 및 삼투압 등의 변화로 인해 후속 응용에 사용할 수 없게 됩니다. Microfluidic 기술을 활용한 WOLF G2® 세포 분류기는 낮은 시료 압력과 customizable sheath fluid를 사용하여 세포의 생명력과 세포막 무결성을 지원합니다.이번 웨비나에서는 특히 아래와 같은 내용을 다룰 예정입니다.FACS 장비를 이용한 식물 세포를 분류시 한계식물 세포 생명력을 보존하기 위한 맞춤형 시액 유체와 낮은 시료 압력의 중요성WOLF G2를 이용한 protoplast, 핵 및 배아형성 미세포를 농축 및 분류하여 단배체 식물로 재생하는 능력 소개Speaker    Dorinda MoelleringSenior Scientist at NanoCellect  Dorinda Moellering is a Senior Scientist at NanoCellect Biomedical and a member of the applications development team.  She develops applications for cell sorting in plant/agriculture, marine biology, and mammalian research spaces.  She has over 15 years of biotech industry experience – five years working on algal biofuels, and a decade in plant cell biology and flow cytometry.  Her undergraduate and graduate research studies focused on understanding biological processes and roles of numerous phytoplankton species which are key to carbon fixation in the world's oceans.  Dorinda has a Master of Science degree in Molecular and Cellular Biology from California State University San Marcos and a Bachelor of Science degree in Marine Biology from the California Polytechnic State University San Luis Obispo.  

조직을 손상시키지 않고 조직 내에서 유전자 발현을 정량화하고 위치를 파악함으로써 세포 유형, 세포간 상호작용 및 세포 상태의 공간 구조를 탐색할 수 있는 강력한 도구로 떠오르고 있는 공간적 분해능을 갖춘 단일 세포 분석은 중요한 역할을 하고 있습니다.Xenium Analyzer는 조직 내 RNA의 매우 민감하고 특이적인 검출을 통해 In Situ 분석을 수행할 수 있는 토탈 솔루션을 제공하며, 샘플을 기기에 장착한 후 일련의 decoding 및 분석 과정이 완전 자동으로 실행됩니다. Xenium은 fresh frozen 및 FFPE 샘플을 지원하며, Xenium In Situ 워크플로우를 사용하여 처리된 조직 절편은 실행 후에도 대부분 그대로 유지되어, 면역형광 염색, H&E 염색 및 Visium CytAssist 기기를 사용한 전체 전사체 프로파일링과 같은 추가 어플리케이션에 사용할 수 있습니다.이번 웨비나에서는 Xenium을 이용한 공간적 단일 세포 생물학의 여러 예시를 보실 수 있으며, 또한, RNA 프로파일링 및 세포 유형 분류, isoform 검출, 리간드 신호 및 세포 유형 차별화 등을 어떻게 규명해 내는지 확인할 수 있습니다. Speaker     Byron Hartman PhD Staff Product Manager, Xenium Assays 10x Genomics

유전자 발현 정보를 형태학적 맥락과 함께 평가하는 것은 생물학과 질병의 진행을 이해하는데 중요합니다. 복잡하고 이질적인 조직을 high-throughput 방식으로 분석하는 것은 어려운 과제였으며, 특히 유전자 발현에 대한 사전 생성된 가정 없이 이를 수행하는 것은 더욱 어려웠습니다.10x Genomics에서 양일간 진행하는 Spatial Webinar Series에서는 Visium Spatial 제품을 사용하여 H&E 또는 면역 형광 염색된 fresh frozen 또는 FFPE 조직 절편의 전사체를 분석하는 방법을 소개해 드릴 예정입니다. 또한 공간 분석 방법, 샘플 처리 방법, 데이터 분석 워크플로우에 대한 정보를 얻을 수 있습니다.●   11월 1일: 공간 분석 - 실험 설계, 분석 및 모범 사례●   11월 2일: 공간 데이터 분석 - QC에서 시각화까지의 워크플로우Speakers    Ivonne Petermann, PhDSenior Science and Technology Advisor, ANZ10x Genomics    Quy Xiao Xuan Lin, PhDSenior Scientist, Applied Bioinformatics10x Genomics