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전혈(Whole Blood)을 직접 고정하여 원하는 일정에 맞춰 단일 세포 분석 연구 수행혈액 샘플을 이용한 단일 세포 분석은 질병의 기전을 발견하고 환자를 분류하여 약물의 효능 및 독성을 평가하는 데 도움이 될 수 있습니다. 그러나 단일 세포 분석은 혈액을 보관하고 운송하는데 편리한 혈액 보존 방법들과 호환되지 않았습니다. 이러한 문제를 해결하기 위해 10x Genomics는 새로운 샘플 준비 워크플로우를 개발했습니다. 이 워크플로우를 통해 전혈을 이용한 단일 세포 분석을 원하는 일정에 따라 수행할 수 있게 되었습니다. 이 프로토콜은 Chromium Single Cell Gene Expression Flex assay를 사용하여 전체 혈액을 직접 고정하는 것으로, 세포를 분리하고 저장하며 운송할 수 있게 해주는 첫 번째 방법입니다.이번 웨비나에서 전혈의 fixation과 이 샘플을 이용한 새로운 워크플로우에 대해 논의하고, 이에 대한 데이터를 자세히 살펴볼 예정입니다. Fixation된 전혈에서 분리된 PBMCs와 백혈구로부터 얻은 복잡성 및 민감도 데이터최대 7일동안 고정한 후 -80°C에서 보관한 샘플에 대한 분석 성능 평가건강한 샘플과 질병 샘플로부터 얻은 고정된 전혈 사용에 대한 결과단일 세포 기술을 사용한 중개연구 샘플의 분석을 위한 혈액 수집 워크플로우를 제공합니다.연자소개    Kelly Martin, PhDCell Biology & Applications Scientist10x Genomics    Connor KunihiroMolecular Biology Scientist10x Genomics

끊임없이 진화하는 연구에 부응하기 위해서는 상응하는 분석 기법도 계속 진화해야 합니다. 10x Genomics의 차세대 GEM-X 기술을 활용하여 단일 세포 분석 연구를 통한 생물학적 발견을 극대화시켜 보십시오.이번 다온비에스에서 진행하는 웨비나에서는 10x Genomics의 혁신기술인 GEM-X 기술과 이 기술을 활용한 Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4와 Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3의 향상된 성능에 대해 소개해 드릴 예정입니다. GEM-X 기술을 기반으로 하는 솔루션들은 이전 단일 세포 분석보다 뛰어난 감도와 견고성을 제공하여 실험 목표를 충족시키고 연구 폭을 넓히는 데 유용할 것입니다. ​이제 단 6분 만에 수십만 개의 세포에 바코드를 부여할 수 있으며, 이 발전된 GEM-X 기술은 다음과 같은 성능을 보여 줍니다.보다 효율적인 microfluidic 기술로 세포 캡쳐율을 80%까지 높임빠른 실행 시간에도 불구하고 세포 스트레스에 부정적인 영향을 미치지 않고, 연약한 세포 캡쳐율도 향상시키는 연구 결과 얻음더 작은 용량으로 두 배로 더 많은 Gel Beads-in-emulsion (GEMs)생성으로 multiplet rate 감소와 처리량 향상개선된 칩 디자인으로 인해 막힘 감소와 성공률 증가GEM-X의 발전으로 향후 어플리케이션 지원 및 지속적인 성능 개선을 위한 기반 마련연자 소개    Pushing the boundaries of performance with the next generation of single cell solutions 유지숙/Jisuk You다온비에스, Field Application Specialist  

단일 세포 연구를 더 발전시키려면 어떻게 해야 할까요? 연구 결과에 집중된 요구가 계속해서 변화하고 있고, 이러한 변화에 대응할 수 있는 분석 도구가 있어야 합니다. 업그레이드된 GEM-X 기술 기반의 assay로 단일 세포 분석 연구를 더 진전시킬 수 있을 것입니다.10x Genomics의 차세대 GEM-X 기술은 single cell 3' gene expression 및 5' immune profiling assay를 지원하며, 검증된 Chromium 워크플로우에 높은 성능과 확장된 연구범위를 제공합니다.이번 10x Genomics 웨비나에서는 GEM-X에 관한 흥미로운 연구결과와 관련 데이터 등을 소개해 드릴 예정입니다.새로운 GEM-X 기반의 단일 세포 분석은 이전 버전과 비교하여 복잡한 샘플에서 민감도 향상더 빠르고 효율적인 microfluidic 기술을 통해 세포 캡처율을 80%까지 높이고 처리량도 2배 증가RNA 함량이 낮아 분석이 까다로운 호중구와 같은 백혈구도 효율적으로 캡처하여 생물학적 이해를 넓힘동일한 세포로부터 BCR/TCR 및 유전자 발현 정보를 얻어 해당 세포의 subtype과 clonotype간의 상관 관계 분석연자    Angela Churchill, PhDProduct Marketing Manager, Single Cell Applications10x Genomics    Jessica Terry, PhDPrincipal Scientist, Molecular Biology10x Genomics

조직 미세환경은 세포의 특징 및 기능, 질병 메커니즘, 그리고 치료 반응에 강력한 영향을 미칩니다. 공간 전사체 프로파일링(Spatially resolved whole transcriptome profiling)은 조직에서 유전자 발현 패턴을 공간적으로 정밀하게 분석할 수 있으며 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 특성화 할 수 있게 합니다.  이번 웨비나는 Spatial transcriptome을 이용한 국내 연구사례와 10x Genomics의 신제품 Visium HD에 대한 내용으로 구성하였습니다. 특히, 연구사례로는 심근경색 동물모델을 사용하여 심근경색 직후의 ‘염증반응기’에서부터 ‘회복기’까지의 면역세포 특성과 역동성을 단일세포 및 공간전사체 분석기술로 연구한 결과를 소개해 드릴 예정입니다. 또한, 10x Genomics의 최신 제품인 Visium HD는 조직 내에서의 전체 전사체의 발현 및 공간 정보를 단일 세포 해상도로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 조직 커버리지에 간격 없이 공간 분석이 가능하며, Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 고해상도의 데이터 품질과 정확한 전사체 공간 정보를 제공합니다. 또한, 이 제품은 보관된 FFPE 블럭 또는 절편화된 조직에서도 사용할 수 있어 데이터 확보에 있어서 이전보다 뛰어난 접근성을 제공합니다.  미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 정확히 정의하고 희귀 세포군을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형에 특이적인 바이오마커 및 약물 표적을 식별 수 있는 10x Visium Spatial Platform에 대한 웨비나에 많은 관심과 참여바랍니다. 연자 소개     Spatiotemporal dynamics of immune cell heterogeneity related to inflammatory responses based on single-cell and spatial transcriptomics​​정승현 교수/Seung-Hyun Jung, PhD가톨릭대학교 의과대학 (생화학교실)    Enter a new era of spatial discovery with Visium HD ​고유정/Yujeong Gho(주)다온비에스/Field Application Specialist

조직 미세환경은 세포의 정체성과 기능, 그리고 질병 메커니즘 및 치료 반응에 매우 큰 영향을 미칩니다. 공간적으로 해결된 전체 전사체 프로파일링은 조직 환경의 생물학적 특성을 편향 없이 확인할 수 있게 합니다. Visium HD Spatial Gene Expression은 조직 커버리지에서 빈 공간 없이 단일 세포 수준에서 전체 전사체를 공간적으로 분석하며, 이를 통해 새로운 발견 가능성을 높입니다.Visium CytAssist 워크플로우를 기반으로 한 Visium HD는 보존되어 있거나 미리 절편화된 FFPE 조직에 대해 이전에 없던 고품질의 정밀한 전사체 공간 정보를 제공합니다.마이크론 크기의 조직 단위로 포괄적인 전사체 정보를 얻어 미세한 해부학적 구조의 세포 구성을 확인하고, 조직 내 희귀 세포군의 역할을 발견할 수 있으며, 공간적 맥락에서 새로운 세포 유형별 특이적인 바이오 마커 및 약물 타킷을 식별할 수 있습니다.이번 웨비나를 통해 Visium HD Spatial Gene Expression을 이용한 새로운 공간적 발견을 경험해 보십시오.- 단일 세포 해상도로 전체 전사체(whole transcriptome) 분석- 캡쳐 영역에 속한 조직 절편 전체 커버리지- 혁신적인 probe와 Visium CytAssist을 이용한 워크플로우를 통해 최고의 데이터 획득연자    Geoff McDermott PhDSenior Science & Technology Advisor10x Genomics